المركز الوطني الخليجي للممارسات الصحية المبنية على البراهينسيعزز دور الجامعة في مجال البحث العلمي تأسيس المركز الوطني الخليجي للممارسات الصحية المبنية على البراهين(NGCEBHP) ، والذي جاء بمبادرة من معالي مدير الجامعة والمدير العام التنفيذي للشئون الصحية بالحرس الوطني الدكتور بندر القناوي، وذلك في شهر محرم 1425هـ الموافق مارس 2004م. وقرر وزراء الصحة في مجلس التعاون لدول الخليج العربية في 29 ربيع الأول 1425هـ الموافق 19 مايو 2004م بان يكون المرجعية المعتمدة في دول الخليج للممارسات الصحية المبنية على البراهين.يهدف المركز إلى تعزيز مفهوم وممارسة الطب المبني على البراهين في المملكة العربية السعودية والمجلس التعاوني لدول الخليج، ويسعى إلى المساهمة في أنتاج ونشر البحوث العلمية ذات الجودة العالية في مجال الطب المبني على البراهين لتكون متاحة للمتخصصين وصناع القرار في مجال الرعاية الصحية في المملكة العربية السعودية ودول مجلس التعاون.للمركز مجموعات عمل محلية في عدد من المراكز الصحية والجامعات السعودية، بالإضافة إلى علاقات عمل مع عدد من الجامعات المراكز المتخصصة في مجال الطب المبني على البراهين في الخارج:
قام المركز خلال العام 2009 بتنفيذ 50 دورة وورشة عمل تدريبية في مجال الطب المبني على البراهين حضرها ما يزيد على 3000 مشارك. ويجري العمل حاليا على خطة لتطوير المركز ليكون مركز تميز يعنى بالرعاية الصحية المبينة على البراهين.